Une jeune fille beyrouthine du quartier de Gemayzé, Labibé Ibrahim Geahchan, fut à l’origine de la création de cette école de jeunes filles. Agée alors de moins de 25 ans, elle commença sa mission comme moniale enseignante dans le quartier de Gemayzé dans une maison qu’elle a louée et que fréquentaient les enfants de la communauté grecque orthodoxe de Beyrouth. E n 1880, une association de dames fut établie dans le but de fonder une école moderne et de procurer aux jeunes filles de la communauté un enseignement de haut niveau. Cette association porta le nom de Zahrat El-Ihsan, mot arabe dont la traduction littérale est “la Fleur de Charité”. Cette nouvelle association, présidée par Mme Zarifé Sursock, aida la jeune moniale Marie (née Labibé Geahchan) à instituer, le 13 Août 1881, cette nouvelle école portant dorénavant le nom d’Ecole Zahrat El-Ihsan.
La nouvelle école grandit rapidement: ses terrains actuels furent acquis par donations, legs et achats, et le bâtiment principal fut achevé en 1895. Un firman ottoman datant du 20 Mars 1896 donna l’autorisation de bâtir l’école et définit sa surface. Il indiqua qu’elle répondait à un besoin de la communauté romaine orthodoxe de Beyrouth de posséder un orphelinat pour les filles et que l’école devait assurer l’éducation des orphelines orthodoxes de Beyrouth. La période allant de la fondation de l’école à la Première Guerre Mondiale fut une ère de grand essor culturel, littéraire et artistique ; les années scolaires étaient échelonnées de rencontres artistiques et de manifestations culturelles.
De nouveaux bâtiments furent plus tard construits pour répondre aux besoins du nombre croissant d’élèves et des obligations modernes de l’enseignement. La dernière acquisition date de 1974 et a été destinée à la jeune Ecole Maternelle. Un nouvel amphithéâtre fut plus tard instauré au sein des bâtiments de l’école et porta le nom de Nayla Ghassan Tuéni. Cet amphithéâtre fut inauguré par son Eminence Le Métropolite de Beyrouth, Mgr Elias (Audi) le 9 novembre 1999. L’école célébra, en 2004 – 2005, son 125ème anniversaire en organisant de multiples activités scolaires, sportives, artistiques et littéraires.